黄瓜 黑星病抗性 CsCcu

研究组装 125 份黄瓜高质量基因组，构建迄今规模最大、质量最高的黄瓜泛基因组。系统刻画结构变异与基因拷贝数变异的全貌，发现 CsFT 串联重复变异是驱动黄瓜早花适应的遗传基础，并首次克隆了参考基因组中已"隐性丢失"的黑星病抗性基因 CsCcu。

中国农业科学院蔬菜花卉研究所组装 125 份黄瓜高质量基因组,构建迄今规模最大、质量最高的黄瓜泛基因组,系统刻画结构变异与基因拷贝数变异的全貌。研究发现 CsFT 串联重复变异是驱动黄瓜早花适应的遗传基础,并首次克隆了参考基因组中已'隐性丢失'的黑星病抗性基因 CsCcu 和受稀有变异调控的果长基因 CsSPL1。论文发表于《自然·遗传学》(Nature Genetics)。

中国农科院蔬菜花卉研究所张圣平研究员团队联合青岛农业大学在国际期刊《自然·遗传学》发表论文,建成当前规模最大、组装质量最优的黄瓜染色体级泛基因组。整合全球422份黄瓜种质重测序数据,筛选125份代表性材料完成染色体水平基因组组装,新增28890个此前从未被报道的非冗余新基因。依据全基因组SNP标记将全球黄瓜划分为印度、西双版纳、欧亚、东亚四大地理类群,系统解析结构变异调控黄瓜地域适应与农艺性状分化的遗传机制,成功克隆黑星病抗性基因CsCcu与果长调控基因CsSPL1,为我国蔬菜种业自主创新提供核心理论支撑与可复制技术范式。