江苏沿江所糯玉米育种专用液相芯片"糯玉芯1.0"成功问世 含5961个高质量SNPs
糯玉米育种专用液相芯片研发成功，技术突破显著，应用前景广阔，属省级科研机构重要进展。
江苏沿江地区农业科学研究所玉米学科团队成功研发出一款低成本糯玉米育种专用液相芯片——"糯玉芯1.0"。基于近300份骨干糯玉米自交系20×重测序,以玉米B73 v5为参考基因组,结合液相探针捕获技术,包含全基因组均匀背景位点和糯玉米专属功能基因位点两大模块,共5961个高质量SNPs。样本检测成功率为100%,平均位点检出率98.5%,分型一致性>99.5%。苗期即可筛选优良单株,缩短育种周期3-5年。该芯片已转让给成都天成未来科技有限公司市场化开发。
近日，江苏沿江地区农业科学研究所玉米学科团队成功研发出一款低成本糯玉米育种专用液相芯片——“糯玉芯1.0”，有效解决了鲜食糯玉米传统育种周期长、进口商用芯片成本高、糯玉米特有品质性状覆盖不足等长期制约种业创新的痛点。
“糯玉芯1.0”是在对近300份遗传变异丰富的骨干糯玉米自交系20×重测序的基础上，以玉米 B73 v5 为参考基因组，结合液相探针捕获技术，系统完成全套位点筛选与标准化探针开发；芯片优化了检测算法与芯片结构，兼顾检测高效性、精准性与低成本优势，包含全基因组均匀背景位点和糯玉米专属功能基因位点两大模块，共 5961 个高质量 SNPs。经过多层严格过滤筛选，该芯片检测稳定可靠，样本检测成功率为100%，平均位点检出率 98.5%，分型一致性＞99.5%，能够实现不同种质资源基因型的精准鉴定。
基于“糯玉芯1.0“，苗期即可筛选优良单株，缩短育种周期3-5年。后续该芯片可广泛应用于糯玉米规模化育种、种质指纹图谱构建、全基因组选择、品质性状基因定位等相关科研及产业化场景，能大幅提升鲜食糯玉米的育种效率。经委托专业技术公司全面检测、核验与数据分析，芯片各项性能指标、检测精度及成本控制标准均达到产业化开发要求，整体数据产出质量较高，具有较大的市场推广前景。
目前，该款芯片已转让给成都天成未来科技有限公司市场化开发，并将面向全国农业科研院所、种业企业、规模化种植主体，提供商业化基因分型检测服务。该芯片研发工作获得江苏省农业科技自主创新资金项目的资助。